Séquençage Sanger

Titre Description Accession Plate-forme Publication
Clone de cDNA Picea glauca Des canaux de résine corticale ont été disséqués en utilisant un système de microdissection au laser à partir de plants d’épinette blanche du génotype PG-653 âgés de 2 ans et induits par le méthyle-jasmonate. GW726474GW732338 Séquençage Sanger Celedon et al 2017
Clone de cDNA Picea glauca Le tissu de cambium a été disséqué à l’aide d’un système de microdissection au laser à partir de plants d’épinette blanche du génotype PG-653 âgés de 2 ans et induits par le méthyle-jasmonate. GW732339GW738147 Séquençage Sanger Celedon et al 2017

Expériences d’ARN-Seq

Titre Description Accession Plate-forme Publication
Analyse d’expression Picea glauca PG-653 LMD Analyses d’expression différencielle Les cellules (cellules corticales de résine (CRD), cellules polyphénoliques de cortex (CP) et cellules de phloème (Phlo)) ont été isolées par microdissection au laser du tissu de l’écorce chez des épinettes blanches traitées au méthyle-jasmonate ou au tween (témoin). Le séquençage de l’ARN a été effectué pour les différents types de cellules isolées pour analyser leur transcriptome. L’expression et l’annotation des transcrits ont été réalisées pour étudier la réponse de défense chez les épinettes blanches pour chaque type cellulaire spécifique. PRJNA290034 Illumina
Hi-Seq
Celedon et al 2017
Allure du développement des pousses de Picea glauca Les pousses ont été échantillonnées pendant 4 semaines durant le développement de ces dernières. Quatre clones ont été individuellement échantillonnés à chaque semaine. Le but de l’expérience était d’étudier les changements dans l’expression des gènes pendant le développement des pousses. PRJNA309861 Illumina
Hi-Seq
Mageroy et al 2017