Séquençage Sanger
Titre | Description | Accession | Plate-forme | Publication |
Clone de cDNA Picea glauca | Des canaux de résine corticale ont été disséqués en utilisant un système de microdissection au laser à partir de plants d’épinette blanche du génotype PG-653 âgés de 2 ans et induits par le méthyle-jasmonate. | GW726474 – GW732338 | Séquençage Sanger | Celedon et al 2017 |
Clone de cDNA Picea glauca | Le tissu de cambium a été disséqué à l’aide d’un système de microdissection au laser à partir de plants d’épinette blanche du génotype PG-653 âgés de 2 ans et induits par le méthyle-jasmonate. | GW732339 – GW738147 | Séquençage Sanger | Celedon et al 2017 |
Expériences d’ARN-Seq
Titre | Description | Accession | Plate-forme | Publication |
Analyse d’expression Picea glauca PG-653 LMD Analyses d’expression différencielle | Les cellules (cellules corticales de résine (CRD), cellules polyphénoliques de cortex (CP) et cellules de phloème (Phlo)) ont été isolées par microdissection au laser du tissu de l’écorce chez des épinettes blanches traitées au méthyle-jasmonate ou au tween (témoin). Le séquençage de l’ARN a été effectué pour les différents types de cellules isolées pour analyser leur transcriptome. L’expression et l’annotation des transcrits ont été réalisées pour étudier la réponse de défense chez les épinettes blanches pour chaque type cellulaire spécifique. | PRJNA290034 | Illumina Hi-Seq |
Celedon et al 2017 |
Allure du développement des pousses de Picea glauca | Les pousses ont été échantillonnées pendant 4 semaines durant le développement de ces dernières. Quatre clones ont été individuellement échantillonnés à chaque semaine. Le but de l’expérience était d’étudier les changements dans l’expression des gènes pendant le développement des pousses. | PRJNA309861 | Illumina Hi-Seq |
Mageroy et al 2017 |
Analyse d’expression Picea glauca – expression différentielle d’individus avec concentrations contrastantes de métabolites | Des branches de 18 cm de longueur ont été échantillonnées. Le profil transcriptomique de 20 arbres phénotypiquement divergent a été comparé. | PRJEB43869 | Illumina NovaSeq |
Laoué et al 2021 |
Analyse d’expression Picea glauca – expression différentielle reliée à la réponse au stress hydrique | Aiguilles de 3 génotypes d’épinette blanche non-apparentées de 3 ans, échantillonnées à 0, 7, 14, 18 et 22 jours après le début du stress hydrique. | PRJNA437248 | Illumina Novaseq |
Depardieu et al 2021 |
Analyse d’expression différentielle Picea sitchensis | Comparaison de transcriptomes constitutifs et induits par la présence de charançons | PRJNA398042 | Illumina NovaSeq |
Whitehill et al 2021 |